بازی Skull and Bones بازیکنها را برای کاوش در اقیانوس هند به دوران طلایی دزدان دریایی میبرد. شما کارتان را با یک کشتی کوچک و معمولی با نام Dhow (جهاز) شروع میکنید و با تلاش به یک ناوگان خواهید رسید. در این مسیر باید خدمه را نیز راضی نگه دارید؛ مگر اینکه بخواهید آنها بهخاطر اوضاع نامساعد دست به شورش بزنند. با اینکه امکان تجربهی بازی Skull and Bones بهصورت انفرادی وجود دارد، اما میتوان با دوستان خود همراه شد.
شما در فعالیتهایی مانند شکار حیوانات، غارت قلعهها و شهرها و البته یورش و غارت کشتیهای سرشار از ثروت شرکت خواهید کرد. امکان پیوستن به سرورهای بازیکن دربرابر بازیکن نیز وجود دارد. در این حالت سایر گیمرها با حمله به کشتی شما درصدد سرقت گنجینهها برمیآیند و درمقابل شما نیز میتوانید تلافی کنید. میزان پیشرفت بازیکنها با Infamy نمایش داده میشود. با تکمیل وظایف میتوان Infamy بهدست آورد و سلاحهای جدیدی برای کشتی آزاد کرد.